国内に常在しない伝染病の侵入を防ぐために海港、飛行場、国境などにおいて旅客その他に対し診察、検査ならびにその他の必要な措置を行なうことです。

わが国では検疫法（昭和２７年１月１日施行）に基づき特定の海港および飛行場において実施されます。

特に検疫伝染病としてコレラ、ペスト、発疹チフス、黄熱及び回帰熱が指定されています。