伝染病患者は病原菌を排出し、感染源となるおそれがあるから、一定の施設に収容するなどして、他の健康者と接触させない方法をとる。

ただし病原体保有者はコレラ以外は隔離しない。

コレラ、ジフテリア、流行性脳脊髄膜炎では24時間以上、赤痢、腸チフス、パラチフスでは48時間以上の間隔で採取した検査材料につき、連続2回以上陰性のときに、隔離を解除できる。