組織におけるガス交換、すなわち血液中から酸素を取り入れ、代謝産物である炭酸ガス（二酸化炭素）を血液中に放出する現象を組織呼吸といいます。この現象は肺におけるガス交換（外呼吸）に対応して内呼吸と呼ばれます。

単位時間に組織から放出される炭酸ガスの量の摂取される酸素量に対する比を呼吸商と呼びますが、平衡状態下においては内呼吸の呼吸商と外呼吸における呼吸商とは等しくなります。